第一百八十三章 老裘，你的病有救啦！(5.4K)(4/6)

操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。

  做过新种检测的同学应该都知道。

  16S相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

  比如有的是97%，有的是99%。

  只是在通常情况下。

  相似度超过97%的，就可以认为是一个物种。

  相似度低于97%的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。

  不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：

  大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99%以上，与其他某某微生物是同一物种。

  总而言之。

  这项技术在定属方面还是靠谱的。

  又过了一会儿。

  裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：

  “老徐，相似度46.9%，46.9%！！”

  “毫无疑问，这是一类新物！”

  徐云认真的看了他一眼，确认道：

  “只有一种新物吗？”

  “没错，只有一种！”

  徐云若有所思的点点头，又道：

  “那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

  众所周知。

  新物鉴定一般都有九个流程：

  1、16S相似度。

  2、形态学观察。

  比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等，还包括最适生长条件的确定。

  3、磷脂脂肪酸鉴定，这个具有属特异性。

  4、呼吸醌，也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种，这个有种特异性。

  5、分子杂交，也就是测定基因组序列，草图就行，然后跟近源物种去比较。

  相似度超过70%是一个种，低于70%是不同物种。

  6、碳源利用情况，看一下能利用哪些碳源，一共有95种碳源的测试。

  7、API试剂盒鉴定，生理生化鉴定的一方面。

  8、GC含量。

  9、革兰氏染色。

  大概经过这些方面的检查，就可以确定是不是新种了。（注：不知道这样写的比较详细大家愿不愿意看？这种详细流程应该没有其他书写过，找人问其实很麻烦的，要是还被嫌水下次我就不写了）

  其中第五个流程，也就是分子杂交这次可以直接忽略——毕竟第一部测出来的46.9%实在是差距太明显了。